赛默飞世尔科技公司最近宣布了一项合作协议的结果,使研究人员能够将高分辨率Orbitrap LC / MS实验的结果与高度策划的生物特异性代谢途径和基因组数据相结合,以快速有效地进行基于质谱的小分子研究和分析。
成功合作的结果,研究人员现在将Thermo Scientific Compound Discoverer 2.1小分子研究软件平台与SRI International的BioCyc直接联系起来,这是一个由9,300个数据库组成的集合,提供有关许多生物的代谢途径和基因组的电子参考资料。 。将统计数据自动地和交互地叠加到这些途径上的能力可以促进对从代谢组学实验获得的结果的生物学解释。最终,这一新链接有望加速Compound Discoverer用户的数据分析,并使他们能够可视化许多单独的化合物测量,以全面了解实验中的生物过程。
今天,代谢组学研究人员可以测量数千种小分子,但与对照相比,知道哪种细胞系统在研究条件下表现不同可能具有挑战性,“蛋白质组学和代谢组学营销,色谱和质谱分析主任Andreas Huhmer说道, Thermo Fisher。“新的整合将允许科学家使用Compound Discoverer自动将检测到的化合物映射到BioCyc代谢途径图,并将其他实验数据(如相对丰度或差异表达)连接到途径上。”
“我们很高兴通过一个直观且易于使用的系统将BioCyc的强大功能带给Thermo Fisher的客户,”SRI International生物信息学研究组主任Peter Karp说。“科学家们现在可以按照从”化合物发现者“到BioCyc代谢途径页面的链接,获得全面的基因组和途径信息知识中心。”
标签: 小分子
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