在致病细菌的全球基因组调查中绘制

研究人员已经绘制了世界上最常见的细菌原因，并揭示了这些细菌如何随着疫苗接种而进化。来自Wellcome Sanger研究所，埃默里大学(美国亚特兰大)和美国疾病控制与预防中心的科学家与世界各地的许多合作者一起开展链球菌的全球基因组调查，在50多个国家发现621株菌株。

该研究发表在“柳叶刀传染病”上，并在EBioMedicine上发表了一篇姊妹论文，揭示了哪种链球菌菌株。(也称为球菌)正在世界各地流传，并解释了为什么尽管现有疫苗，球菌的发病率仍然很高。通过比尔和梅林达盖茨基金会的资助，这项工作将有助于预测哪些菌株对新型球菌疫苗具有重要意义，并表明正在进行的全球基因组监测至关重要。

是一种肺部感染，导致全球每年数十万人死亡，是全球5岁以下儿童死亡的最大单一感染因素*。链球菌是细菌性的最常见原因。健康的人经常携带这些细菌而不会生病，但它们会导致致命的感染，特别是在幼儿和一些成年人中。

在过去十年中，世界上许多国家都引入了球菌结合疫苗(PCV)**。这种疫苗针对每种链球菌细菌周围的皮毛，大大减少了儿童感染的数量。然而，虽然PCV对多达13种重要的皮毛类型非常有效，但已知有超过100种，尽管有疫苗，但球菌的发病率仍然很高。

为了理解并帮助对抗这种感染，研究人员建立了全球球菌测序项目(GPS)，以对全世界的链球菌进行基因组监测。研究人员与世界各地的合作伙伴合作，对超过20,000株链球菌的DNA进行了测序来自51个国家的感染者的样本。

在PCV引入之前和之后收集样品，并比较DNA序列和健康数据。这使得有可能确定细菌的变化，这些变化可能影响疫苗对球菌的保护程度，以及新菌株是否会出现影响疾病严重程度和易于治疗的程度。

研究人员在全球范围内发现了621种遗传毒株，每种毒株与一种或多种皮毛类型相关他们还发现PCV引入后非疫苗型细菌的水平上升，显示细菌如何随着疫苗的进化而进化。

来自Wellcome Sanger研究所的论文资深作者Stephen Bentley教授说：“对全世界的健康构成巨大威胁。我们现在对全球链球菌细菌群体有着前所未有的看法，这是细菌性的常见原因。 ，可以看到导致疫苗逃避的进化变化。这将为全球未来的疫苗战略提供重要信息，并有助于拯救生命。“

来自Wellcome Sanger研究所的两篇论文的第一作者Rebecca Gladstone博士说：“我们的研究给出了链球菌的第一个基因组描述。世界人口。这是以前从未有过的，因为之前只研究过个别种群的样本。现在我们有全球数据，显示每个国家都存在哪些菌株，并且可以用这个来了解世界范围内的球菌感染。“

球菌也可能导致身体其他部位的疾病，例如感染大脑或血液，导致脑膜炎或血流感染，这些都可导致脓毒症。婴儿接种PCV也可以预防这些球菌感染。通过减少儿童链球菌的传播，PCV还可以通过群体免疫力减少成人感染的数量。

来自美国疾病控制和预防中心链球菌实验室项目的联合首席研究员Lesley McGee博士说：“了解世界各地存在的链球菌菌株及其如何发展至关重要回应PCV的引入。这项基因组研究使我们不仅可以看到当前最重要的全球菌株，而且还有助于了解它们的进化。这些信息将为开发预测工具打开大门，以确定疫苗应对中可能出现的菌株。使用。”

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