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为了加快发现速度 红外显微镜脱网

问题:round虫,沙皮笔和高真空油脂有什么共同点?答:最近,在伯克利实验室的Advanced Light Source(ALS)进行的原理证明显微镜实验中,都对它们进行了分析。

在《通信生物学》杂志上,加州理工学院,加州大学伯克利分校和伯克利同步加速器红外结构生物学成像计划(BSISB)的研究人员报告了一种收集“高维”红外图像的更有效方法,其中每个像素都包含丰富的物理和化学信息。借助新方法,现在可以在不到一个小时的时间内完成长达10个小时的扫描,从而有可能将生物光谱的范围扩大到对时间敏感的实验。

加州理工学院化学学研究生,论文的第一作者,伊丽莎白·霍尔曼说:“我们意识到,随着时间的推移,对我们的模型有机体-小线虫秀丽隐杆线虫进行采样,这是出于软件而非硬件原因的挑战。” 。“例如,图像采样仅限于具有矩形边界和采样点之间固定距离的均匀栅格光栅扫描。”

这项新技术是由ALS的第一作者,原加州大学伯克利分校的物理学研究生方源生(Yuan-Sheng Fang)实施的,它采用了一种无网格的自适应方法,该方法可以自动增加显示更大物理或化学对比度的区域中的采样。在概念验证的红外显微镜实验中,研究人员检查了两个样品。

第一个是两组分系统,其中两个组分(永久标记墨水和高真空油脂)都得到了很好的表征。用肉眼很难清楚地看到样本的详细信息,因此这是对软件如何在人类实验人员的最少指导下运行的良好测试。第二个样本是活的幼虫秀丽隐杆线虫(C. elegans),这是成千上万的研究人员研究的生物学模型系统。

在这两种情况下,自主自适应数据获取(AADA)方法均明显优于非自适应方法。在第二个示例中,增加的采样密度与已知的秀丽隐杆线虫解剖特征相对应,并且使用市售软件在45分钟(约4.9小时)内绘制了头部区域。

霍尔曼说:“除我们已发表的具体工作外,结果表明将AADA集成到现有的基于扫描的卫星,无人机和/或显微镜技术中可以促进从高光谱遥感到海洋和太空探索等领域的研究。”

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