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新方法推动了单细胞转录组学技术的发展

导读 单细胞转录组学方法使科学家能够一对一地研究成千上万来自活生物体的单个细胞,并对每个细胞的遗传物质进行测序。在每种细胞类型中,基因的

单细胞转录组学方法使科学家能够一对一地研究成千上万来自活生物体的单个细胞,并对每个细胞的遗传物质进行测序。在每种细胞类型中,基因的激活方式不同,从而产生了神经元,皮肤细胞和肌肉细胞等细胞类型。

单细胞转录组学使科学家能够鉴定出每种细胞类型中活跃的基因,并发现这些遗传差异如何改变细胞的身份和功能。仔细研究这些数据可以发现新的细胞类型,包括以前未观察到的干细胞,并帮助科学家追踪复杂的发育过程。

“单细胞转录组学已经彻底改变了生物学,但仍处于活跃发展的领域,”博士学位的Helena Garcia Castro解释说。牛津布鲁克斯大学生物与医学系的学生,也是该论文的合著者。

“目前的方法是将细胞解离方案与'活'组织一起使用,这会使细胞承受压力,导致细胞发生改变,并限制了精确的研究。”

为了解决这个问题,研究小组使用了历史研究方法,并重温了19世纪和20世纪的过程,创建了ACME(乙酸甲醇乙醇解离)方法。

科学家们意识到,使用这种方法,细胞不会停止解离,因为它从研究开始就停止了其生物活性并“固定”了它们。

然后,ACME方法允许在整个过程中将细胞冷冻保存一次或数次,无论是在解离过程之后,在现场还是在进行多步操作方案时,都将其冷冻保存。

牛津布鲁克斯大学研究学者Jordi Solana博士补充说:“这意味着科学家现在可以在实验室之间交换样品,保存细胞材料,并且可以冷冻大量样品以进行同时分析,而不会破坏遗传材料的完整性。在牢房里。

“我们从旧论文中采用了该方法,并对其进行了重新设计,使其能够与当前的单细胞转录组学技术一起使用。借助我们的新方法,我们现在着手表征许多动物的细胞类型。”

现在,借助ACME方法,科学家们能够与其他实验室合作,研究更广泛的动物细胞。如果没有分离和冷冻活细胞组织的技术,这将是不可能的。

论文“ ACME解离:一种用于单细胞转录组学的通用细胞固定-解离方法”发表于Genome Biology。

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