将高速基因测序用于水纯度测试

获得清洁水是公共卫生的一个基本组成部分，但是自从罗伯特·科赫(Robert Koch)在19世纪80年代帮助开创了疾病的细菌理论以来，导致水传播疾病的细菌，病毒和原生动物的测试基本上没有什么变化。

现在，威斯康星大学麦迪逊分校工程学院出现的一家初出茅庐的公司承诺通过将高速基因测序应用于检测这些病原体的难题，并首次计算这些病原体，从而改变这种状况。

Pathogenomica首席执行官Francisco Moya表示，今天的方法太慢而且过于具体。“现有技术的问题是它们需要特定的测试来识别每种病原体。你需要一个接一个地看。“

目前，样品中的生物体在实验室培养皿中培养，这可能需要长达两周的时间。然后，在它们充分增加后，对它们进行病原体检测。但每项分析都针对一种特定的病原体。

有很多潜在的病原体，但测试它们的成本很高--Moya将这个任务比作试图打开数百个锁的任务。“使用当前的技术，您必须为每个锁设计一个不同的密钥。想出主密钥要简单得多。我们将下一代测序称为主密钥，因为它可以解锁样品中存在的所有已知病原体。“

莫亚说，清洁水的斗争远未结束。据世界卫生组织估计，由于供水，卫生和个人卫生方面的问题，每年有842,000人死亡。

Pathogenomica的更好的想法集中在可用于确定细菌，病毒和原生动物身份的遗传物质的标记链上。这些被称为16S rRNA的链中的一种已被用于鉴定细菌约25年。但是直到最近，对于水质实验室的常规使用来说，必要的测序过程太慢且昂贵。

博雅说，不再是博士。土木和环境工程的候选人。

他说，一旦公司在一年左右开始运营，这将是一个非常简单的过程。“客户发送样品，我们进行测序，我们将结果与专有数据库进行比较，将微生物分类为致病性或非致病性 - 一个坏人或好人。”

此时，客户收到一份报告，显示病原体的身份，以及风险评估和显示微生物分类的交互图。

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