第一个广泛耐药(XDR)的鼠伤寒沙门氏菌(SalmonellaTyphimurium)菌株是刚果民主共和国(DRC)在撒哈拉以南非洲每年造成数百万血液感染的病原体。耐药性已经在连续组增加S.伤寒随时间。这些新菌株对刚果民主共和国的一种常用药物具有抗药性，其中一种样品对这种最终抗生素的敏感性降低。
这项研究于今天(2019年9月19日)在Nature Communications上发表，由安特卫普热带医学研究所(ITM)，刚果民主共和国国家研究所(INRB)，威康桑格研究所，大学的研究人员进行。剑桥大学及其合作者。调查结果表明，S.鼠伤寒沙门氏菌在撒哈拉以南非洲地区已经发展在过去几十年，并继续这样做。需要采用多方面的方法来追踪和控制XDR沙门氏菌的传播，包括进一步的微生物和基因组监测。
大多数沙门氏菌感染导致与食物中毒相关的症状。虽然令人不快，但在绝大多数病例中症状不会危及生命。但在撒哈拉以南非洲，沙门氏菌如S.鼠伤寒沙门氏菌可引起血液，被称为侵入非伤寒感染沙门氏菌(整数)感染。
每年，INTS感染估计影响到340万人，并导致全球681316人死亡，其中大部分是由引起S.鼠伤寒沙门氏菌。在刚果民主共和国等地区对iNTS感染的控制和治疗由于获得医疗保健，基础设施面临的挑战和免疫力下降而变得复杂，五岁以下的儿童尤其处于危险之中。
已知的是，在撒哈拉以南非洲的整数感染是由一种类型的主导S.称为ST313鼠伤寒沙门氏菌，其与抗生素抗性相关。两组ST313(命名为血统I和II)独立分裂，随后分布在非洲。随着时间的推移，抗生素耐药性一直在增长，血管II现在是iNTS感染的主要原因。
现在，全球研究伙伴关系正在努力了解沙门氏菌ST313如何继续发展和发展耐药性。对收集到的来自刚果(金)人民医院疑似血流感染的血液样本的工作，从INRB和ITM研究人员观察到的抗生素抗性水平从未见过S.鼠伤寒沙门氏菌引起血流感染，包括对抗生素阿奇霉素抗性-通常在储备中持有的药物案例其他证明无效。
为了更好地理解这些发现，这些菌株进行了基因组测序和分析，包括ITM和Wellcome Sanger研究所的生物信息学分析和实验室实验，以及基因组病原体监测中心(CGPS)的机器学习分析。对这些鼠伤寒沙门氏菌基因组的分析鉴定了一个新的亚组，该亚组从ST313分支，命名为谱系II.1。据估计，这一新组织于2004年出现，具有广泛的耐药性(XDR)。
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