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ATCC推出参考质量基因组序列的新数据库以协助生物学研究

导读 ATCC推出了新的ATCC Genome Portal,这是一个公开的参考质量基因组序列数据库,与经过身份验证的ATCC生物材料相匹配,这将有助于研究人员

ATCC推出了新的ATCC Genome Portal,这是一个公开的参考质量基因组序列数据库,与经过身份验证的ATCC生物材料相匹配,这将有助于研究人员满怀信心地解释和再现其结果。该门户网站最初以广泛使用的细菌菌株的250个基因组序列启动,实现了ATCC的“增强认证计划”,该计划是“难以置信的2020年计划”旨在提高生物研究可重复性的五项核心承诺中的第一项。

当前公开可用的基因组序列缺乏真实性,质量,完整性或可追溯性,这会损害结果。由于缺乏用于开发和验证参考质量基因组序列的标准化方法,这一问题更加严重。

ATCC通过开发用于生成参考质量基因组的标准化工作流程来解决此问题。从低合格的经过验证的ATCC材料开始,并使用标准化的下一代测序和杂交组装方法,ATCC通过将高精度的短读本与超长读本的支架功能相结合,产生了完整的参考质量基因组。此工作流程的每个步骤均经过严格的质量控制分析,以确保进入下一步的数据尽可能达到最高质量—只有通过所有质量控制标准的数据才发布到ATCC基因组门户。

为了使科学家能够准确地解释其结果并与计算机模拟模型进行深入的关联,他们需要获得经过严格验证的参考基因组,这些参考基因组与可靠的生物材料相关联。通过我们的增强身份验证计划,我们已经确定了现有公开数据的主要挑战,并开发了一种用于提高参考基因组序列质量的解决方案。我们很高兴能够为科学界提供这种资源。”

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