分析栽培可可树基因组的研究人员追溯到大约3600年前的“单一驯化事件”。这一发现为人们开始种植巧克力来源的时间和地点的长期争论开辟了新的前沿。
“这一证据增加了我们对人类如何在美国移动和建立的认识，”华盛顿州立大学人口遗传学家奥马尔科尔内霍说，他是一篇关于通信生物学研究的文章的主要作者，这是一本来自自然出版社的开放获取期刊。“这本身就很重要，因为它为我们提供了一个时间框架来提出可能更棘手的问题：制作一个好的可可需要多长时间?驯化过程有多强?驯化一棵树需要多少植物?”
该研究涉及来自11个机构的18位科学家，他们还发现可可的驯化最终选择了风味，抗病性和兴奋剂可可碱。然而，这是以保留降低作物产量的基因为代价的。
研究人员在2010年对Theobroma cacao基因组进行了测序。其中列出了Cornejo所指的可可基因组的原型，而这项研究通过对200株植物进行测序，梳理出可揭示植物进化历史的基因组变异。
研究人员研究了“可可的王子”，克里奥罗 - 稀有，美味，并且是第一个被驯化的人。他们发现它在3600年前在中美洲被驯化，但起源于亚马逊盆地，靠近哥伦比亚南部和厄瓜多尔北部的现代边界，来自古老的种质库拉雷。Cornejo说，交易商可能会将它介绍给中美洲。
当时树木的种群由437至2,674棵树组成，最可能是738棵树。3，600年前的驯化时间为2,481和10，903年前，与奥尔梅克陶器中可可碱的痕迹以及古代和现代人类DNA的大规模分析一致，这些分析使大美洲的殖民化大约在13000年前。
研究人员还看到了一种假设认为驯化带来成本的假设，因为种植者在选择具有理想特性的植物时，最终会使植物积累适得其反的基因 - “有害突变” - 使它们不那么合适。
该研究的见解可以帮助确定育种者可以强调的特定性状背后的基因，包括产量。
“我们希望拥有一种方法，将来自高生产力人群的植物 - 如伊基托斯 - 与Criollo植物的植物结合起来，同时保留所有这些令人满意的特性，使Criollo cacao成为世界上最好的，”Cornejo说。 。
Cornejo在WSU工作，在那里他使用了研究计算中心的高性能计算能力进行分析，以及斯坦福大学，他是Carlos Bustamante实验室的博士后文章的作者，在那里完成了数据的排序。该研究的资金来自Mars，Incorporated，该公司已经对可可基因组进行了大量的序列和研究。
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