分子生物学家长期以来认为基因组3D组织中的结构域控制基因的表达方式。在研究了果蝇中高度重排的染色体后，EMBL研究人员现在揭示，虽然这是某些基因的情况，但是它们的结果对许多其他基因的普遍性提出了挑战。他们的研究结果于7月15日发表在Nature Genetics上，揭示了3D基因组组织(也称为染色质拓扑)与基因表达之间的脱钩。
我们的染色体被划分为域。控制基因表达的DNA的调控区域 - 所谓的增强子 - 通常位于与其靶基因相同的染色质结构域(称为拓扑相关结构域)中。迄今为止，有许多有趣的例子，其中域限制增强子的活性仅限于其域内的基因。
为了更系统地测试这些发现的一般性，来自EMBL的Furlong和Korbel小组的研究人员利用果蝇中的遗传工具来研究高度重排的突变染色体。Yad Ghavi-Helm，Alek Jankowski，Sascha Meiers及其同事发现染色质结构域的变化并不能预测基因表达的变化。这意味着除了结构域之外，还必须有其他机制来控制增强子与其靶基因之间相互作用的特异性。
教诲教条这些结果质疑了该领域当前教条的普遍性，染色质结构域(TADs)对于约束和限制增强子功能至关重要。
我们能够证明，基因组的3D组织的主要变化对大多数基因的表达几乎没有影响，至少在这种生物学背景下。结果表明，虽然一些基因受到影响，但许多基因对其染色质结构域的重排具有抗性，并且只有一小部分基因对其拓扑结构的这种变化敏感。
标签： 染色质拓扑
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