由巴塞罗那基因组调控中心的RodericGuigó领导的国际科学家团队表明，由死亡引发的不同组织中基因表达的变化可用于预测个体的死亡时间。正如今天在Nature Communications发表的一篇论文中所报告的那样，研究人员建议，通过分析一些现成的组织(例如肺部或皮肤组织)，可以相当准确地确定死后间隔(自死亡以来经过的时间)并且可能具有对法医分析的影响。
这一切都始于GTEx项目，该项目旨在为科学家创建一个参考数据库和组织库，以研究基因组变异如何影响基因活动和疾病易感性。GTEx被设计用于从大量个体中采集尽可能多的组织，以便了解基因和变体的因果效应，以及哪些组织有助于疾病的易感性。“GTEx数据使我们能够在一个组织和多个组织中询问遗传变异及其对基因表达的影响。由于我们使用的样本均来自已故捐献者，我们需要查明与死亡或死亡时间相关的基因表达是否有变化，因此我们可以更好地模拟我们对组织或疾病之间变异的预测，“ RodericGuigó解释道，
为了解一个人死亡后基因表达的组织特异性变化，RodericGuigó和他的同事研究了GTEx项目中来自54个捐赠者的36个不同组织的7,000多个样本的RNA测序数据。他们表明死亡的时间对基因表达有影响，并且这种效应因组织而异。作者使用细胞的高通量测序基于这些组织特异性基因表达变化开发了用于预测死后间隔的模型。
“我们发现许多基因在相对较短的死后间隔内以很大程度上以组织特异性的方式改变表达。这些信息有助于我们更好地了解变异，并且它使我们能够识别生物体内死亡引发的转录事件，“目前在葡萄牙波尔图大学分子病理学和免疫学研究所的CRG校友Pedro G. Ferreira补充道。
标签： 基因表达
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