2012年，VIB-KU鲁汶微生物中心Jeroen Raes教授发起了佛兰德肠道菌群项目。Raes教授和他的团队对超过3,000名健康志愿者的粪便样本进行了测序，从而确定了与健康相关的正常肠道菌群的边界。接下来，研究小组转向患者组，以确定与疾病相关的微生物组变化。最近，他们描述了所谓的B2肠型，缺乏某些抗炎细菌。今天，他们在多种诊断中普遍存在的这种特定肠型的结果发表在《自然微生物学》上。
比较微生物组
炎症性肠病(IBD)将以肠道慢性炎症为特征的几种疾病分为几类，包括溃疡性结肠炎和克罗恩氏病。原发性硬化性胆管炎(PSC)是一种慢性肝病，涉及炎症和胆管瘢痕形成，通常伴有IBD。VIB-KU鲁汶大学的科学家在他们的新研究中描述了患有IBD和PSC的患者的微生物组组成。
Jeroen Raes教授(VIB-KU鲁汶大学)：“多年来，全世界许多研究小组都试图描述与疾病相关的微生物群改变。尤其是IBD是微生物组研究中的热门话题。我们的研究与之前在三个方面的尝试不同首先，我们比较了弗拉芒肠道菌群项目目录中超过3,000个微生物群的健康志愿者的患者菌群;其次，在我们的分析中，我们不仅查看了粪便样本中存在的不同细菌的百分比，而且还使用了一种新技术来量化它们的丰度。第三，我们纠正了诸如粪便稀疏等因素的研究结果，粪便稀疏通常是所研究疾病的症状，但会影响微生物组分析的结果。”
疾病的微生物指纹
鲁汶的科学家们将其在定量微生物组分析方面的独特专业知识与对与健康相关的微生物群变异的知识相结合，从而确定了一种微生物组结构发生了变化，也被称为肠型，在患者人群中患病率很高。尽管在13%的健康志愿者中观察到了这种肠型，但在38%至78%的PSC和IBD患者中可以识别出这种肠型。
UZ鲁汶/ KU鲁汶大学的肠胃病学家SéverineVermeire教授澄清说：“这种异常的微生物组构型，我们称为B2肠型，具有细菌丰度低和生物多样性低的特点。 -细菌，例如Faecalibacterium。事实上，我们在B2型肠型患者中检测到更高水平的肠道炎症。即使在健康个体中，这种肠型携带者的整体低度炎症水平也略高。”
肠道发炎，微生物和抑郁症
出乎意料的是，仅在几个月前，Raes教授的实验室就描述了类似的微生物群改变与生活质量降低甚至抑郁有关。
Jeroen Raes教授说：“在不同患者组中观察到的微生物组变化似乎有很大的重叠。我们在大约26%的抑郁症患者中检测到B2肠型。虽然肠道菌群已显示出在疾病发展中的作用例如在溃疡性结肠炎和克罗恩氏病中，对于抑郁症尚不十分清楚。但是，我们将在以后的研究中更详细地探讨B2肠型与抑郁症之间的关系。”
虽然大约13%的健康个体可以被归类为B2肠型携带者，但研究人员强调，这不应成为引起关注的原因。
Jeroen Raes教授：“在这一点上，我们无法根据人的肠型对疾病的易感性或风险做出任何预测。此外，肠型不是固定的，可以通过例如改变饮食来改变。观察到的疾病之间的关联和微生物群并不意味着肠道细菌确实是导致疾病的原因，许多个人，生活方式和环境因素都与B2肠型有关，但是，由于炎症在某些个体中也与B2相关，因此我们将无疑，我们将进一步研究潜在的因果关系。”
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