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蓝脑项目发布了开创性的3D脑细胞图集

导读老鼠大脑中每个细胞的第一个数字3D地图集为神经科学家提供了以前无法获得的有关所有737个大脑区域的主要细胞类型,数量和位置的信息-这可能

老鼠大脑中每个细胞的第一个数字3D地图集为神经科学家提供了以前无法获得的有关所有737个大脑区域的主要细胞类型,数量和位置的信息-这可能极大地促进大脑科学的进步。由EPFL的“蓝脑计划”发布,并在《计算神经科学前沿》上发表,《蓝脑细胞图集》将数千种全脑组织染色的数据整合到了一个全面,交互式和动态的在线资源中,可以用新发现不断对其进行更新。这一突破性的数字地图集可用于分析和进一步建模特定的大脑区域,并且是全面模拟啮齿动物大脑的重要一步。

“尽管在过去的一个世纪中进行了大量研究,但仍仅对4%的小鼠大脑区域提供了细胞数量-这些估计值经常相差多达三倍,” Blue Brain项目创始人兼所长,亨利·马克兰姆教授说。“ Blue Brain Cell Atlas通过提供即使是小鼠大脑最小已知区域的最佳估计值也解决了这个问题。”

CsabaErö的首席作者和创建者解释说:“了解电路组件及其布置方式也是大脑建模的重要起点-例如,人口统计数据对于构建国家模型至关重要。”

以细胞规模在大脑中导航

先前的脑图集由染色的脑切片的图像堆栈组成。有些可以显示整个大脑的精确细胞位置,而有些则可以显示特定的细胞类型,但是没有一个可以将这些有价值的数据转换为数字可导航图集形式的大脑中所有细胞的数量和位置。

这一革命性的步骤花费了五年的时间仔细收集并整合了数千种脑组织染色。Erö及其同事主要依靠从艾伦脑科学研究所获得的所有成像数据,并将其与大量其他解剖学研究相结合,以计算和验证小鼠每个区域的主要细胞类型,数量和位置大脑-包括以前从未获得过细胞数据的所有区域。

“我们的细胞图集就像从手绘地图到城市和地理特征的卫星图像的数字化版本一样-允许我们以Google Earth允许我们导航地球的方式来导航大脑,” Marc-奥利弗·盖瓦蒂格(Oliver Gewaltig)。“它是3D,高分辨率,可搜索,可导航,已注释,易于使用-填补了我们对96%鼠标的大脑区域的知识的巨大空白。”

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